Le roman est la suite de La Marche de Radetzky. Il met en scène Franz Ferdinand Trotta, cousin de Carl Joseph, dans la Vienne de l'après-guerre, jusqu'aux événements de 1938 et à l'Anschluss. Le personnage d'Elisabeth y tient un rôle important. Le titre renvoie à la crypte impériale de Vienne, où reposent les Habsbourg. Le récit, plus bref que celui de La Marche de Radetzky, est mené par le personnage principal, ce qui donne au livre le ton d'une confession : le narrateur voit son monde se défaire et ne sait plus où placer ses fidélités, jusqu'au moment où l'histoire le rattrape.
La Crypte des Capucins a paru en 1938, à Amsterdam, chez Querido, un éditeur qui publiait alors des auteurs en exil. La traduction anglaise de John Hoare est publiée par The Overlook Press en 1984, suivie en 2013 par celle de Michael Hofmann chez New Directions. Une édition critique allemande, avec commentaire, a paru chez Reclam à Stuttgart en 2013. Le roman a inspiré le film Trotta, de Johannes Schaaf (1971).
Ce dernier grand roman de Roth fait le lien entre l'effondrement de l'empire et la catastrophe qui va suivre. Il montre ce que devient un monde quand ses fondations disparaissent, et comment l'Autriche a pu se laisser absorber. Écrit en exil, quelques mois avant la mort de l'auteur, il se lit comme un adieu, à la fois ironique et désespéré, à la patrie perdue.